Ответ простой.
Все изменения по нашему сайту (число проиндексированных страниц, число ссылок и прочая) - мы видим пока только в Вебмастере :) Это никак не отражается на поисковой выдаче. С определенным периодом все эти изменения становятся доступны в выдаче - и посещаемость сайта резко меняется.
Вот скан из Вебмастера Гугль - хорошо видна вертикальная линия с отметкой "Обновление". Это как раз все изменения по сайту были выложены для участия в поисковой выдаче. Все радуются.

Скажем, после обновления можно увидеть результат работы сеошников над сайтом. Пока обновления не было, все изменения с сайтом не отражались на его позициях.